Vääksynjoessa on ollut vesimyllyjä jo keskiajalla.

Vääksynjoki on ollut tärkeä vesireitti ja asuinpaikka jo muinaisina aikoina. Joessa on ollut useita vesimyllyjä ainakin 1400-luvulta lähtien. Jäljellä on Vesimyllymuseoksi kunnostettu etumylly, joka on yksi harvoista toimintakuntoisista vesimyllyistä Suomessa.

Takamyllystä muistuttavat enää massiiviset lohkokiviperustukset, jotka on suojeltu muinaisjäännöksenä. Takamyllyssä eli Anianpellon myllyssä jauhoi aikanaan kaksi kiviparia, joista toinen kuului Anianpellon talonpojille ja toinen Mikkolan kartanolle. Rakennuksessa toimi myös meijeri, kunnes osuusmeijerin uusi rakennus valmistui vuonna 1927. Myöhemmissä vaiheissa rakennuksessa oli myös kioski, jonka terassilta saattoi ihailla jokimaisemaa. Takamylly paloi lokakuisena yönä vuonna 1956. Syttymisen syyksi on kerrottu milloin salama, milloin tupakan tumpista syttynyt kuiva jauhopöly. Takamyllyn kivijalka täytettiin sittemmin maalla näköalapaikaksi, josta voi seurailla vaikkapa Vääksynjoen kuohuntaa ja vesilintujen menoa.